Transparency International Slovensko v spolupráci s mestom Martin od júla 2008 pracovala na projekte Audit a príprava vybraných protikorupčných opatrení v meste Martin. Cieľom bolo zavedenie komplexného balíka protikorupčných opatrení v 17 kľúčových oblastiach činnosti mesta. Spoločný projekt mesta a TIS spočíval na troch fázach:
- v prvej fáze išlo o audit jednotlivých politík, čiže zistenie problematických oblastí náchylných na vznik korupcie, ktoré boli zhrnuté do správy z auditu politík Mesta Martin,
- druhou fázou bolo spracovanie konkrétnych návrhov protikorupčných opatrení na odstránenie alebo elimináciu priestoru pre vznik kokrupcie a netransparentnosti,
- treťou, a zároveň poslednou fázou projektu bola implementácia návrhov protikorupčných opatrení.
V rámci projektu sa uskutočnil tréning pre obstarávateľov pod názvom Transparentnosť a integrita vo verejnom obstarávaní, na ktorom sa predstavila celá sada príkladov dobrej praxe verejného obstarávania inšpirovaná zahraničnými, ale aj slovenskými skúsenosťami.
Dňa 10. decembra 2009 sa uskutočnila konferencia s názvom Výzvy slovenského súdnictva a možnosti zlepšenia existujúceho stavu, ktorá sa venovala aktuálnym problémom súdnictva a možným riešeniam na ich odstránenie a zvýšenie profesionality, nestrannosti a kvality súdnictva na Slovensku. Na konferencii vystúpili napríklad podpredseda Ústavného súdu ČR Pavel Holländer, advokát a pedagóg Radoslav Procházka, sudca Paul Springer z nemeckého Siegenu, Jana Dubovcová z Okresného súdu v Banskej Bystrici a ďalší.
Projekt bol zameraný na analýzu legislatívy a porovnávanie mechanizmov ochrany whistleblowerov (oznamovateľov nekalých praktík na pracovisku) v ôsmich krajinách EÚ a identifikovanie najlepších praktík v tejto oblasti. Súhrn takýchto praktík pomôže Slovensku a uskutočniť čo najlepšiu legislatívu o ochrane whistleblowerov.
TIS v rámci projektu monitorovala a analyzovala rozhodnutia centrálnej správy ohľadne poskytovania dotácií obciam- aj z hľadiska transparentnosti aj straníckej náklonnosti, a následne presadzovala navrhnuté odporúčania zamerané na zvýšenie transparentného a objektívneho rozhodovania o alokácii verejných zdrojov miestnym samosprávam.
Cieľom projektu je uskutočniť rozsiahly prieskum verejnej mienky, ktorý umožní zachytiť vývoj a trendy v danej problematike, zmapuje oblasti citlivé na korupciu a časový rád dát, ktorý má TIS z predchádzajúcich prieskumov a umožní porovnávať úspešnosť protikorupčných stratégií prijatých jednotlivými vládami SR. Zároveň umožní na základe aktuálnych dát presnejšie definovať protikorupčné nástroje potrebné na obmedzenie priestoru na korupčné správanie v spoločnosti.